在开发Web应用程序时，我们经常将各种文件放在服务器的根目录下。这些文件可能包括配置文件、敏感数据文件或者仅供内部使用的脚本。如果这些文件能够被用户直接通过浏览器访问，那将带来严重的安全风险。
1. 使用 .htaccess 文件
.htaccess（超文本访问）文件是一种配置文件，提供针对目录改变配置的方法，即在一个特定的网站目录中放置一个包含一个或多个指令的文件，以修改该目录中的设置。Apache服务器会逐行读取这个文件，并按照指令进行处理。要阻止对某些文件的直接访问，可以在项目根目录下创建一个名为 .htaccess 的文件，并添加以下内容：
<Files "config.php"> Order allow,deny Deny from all</Files>这段代码表示禁止任何客户端对名为 config.php 的文件进行访问。你也可以用通配符来匹配一组文件，如：.php 或者 .inc。如果你想保护整个文件夹不被访问，可以使用如下命令：
deny from all2. 将敏感文件移出公共HTML目录
除了利用 .htaccess 文件外，还可以考虑把所有非公开资源移动到 Web 服务器无法触及的位置，例如位于站点根目录之外的某个位置。这样即使有人知道文件路径也无法从外部网络上获取它们。
3. 利用 PHP 内置函数
对于一些必须存放在公共 HTML 目录内的文件，可以通过编程方式实现保护。比如，在文件开头处加入判断语句，检查当前请求是否来自合法来源。如果是非法请求，则终止脚本执行并返回错误信息。下面是一个简单的例子：
if (!defined('MY_APP')) { die('This file cannot be accessed directly.');}然后，在主程序入口点定义常量 MY_APP 来确保其他部分正常工作：
define('MY_APP', true);require_once 'config.php';以上介绍了几种有效的方法来防止 PHP 服务器根目录下的文件被直接访问。根据实际需求选择合适的方式非常重要，同时也要注意不要影响到正常的业务逻辑。最后提醒大家，任何时候都要保持良好的编码习惯和安全意识，尽可能减少潜在的安全隐患。
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