GPU加速计算任务提交方法是什么?

1. 编写作业脚本:首先需要编写一个作业脚本,该脚本会指定所需的资源(如CPU、GPU数量),作业名称、输出和错误文件的位置等。例如,在使用SLURM调度系统时,可以创建一个包含这些信息的脚本文件(如cuFFTtest.slurm),然后通过sbatch命令提交作业。

2. 加载必要的模块:在作业脚本中,通常需要加载相应的软件模块,如CUDA、cuFFT、GROMACS-GPU等。例如,使用GROMACS-GPU时,需要加载GROMACS-GPU、OpenMPI和CUDA工具包。

3. 指定GPU资源:在作业脚本中,可以通过参数如--gres=gpu:来指定所需的GPU数量。例如,在瀚海20超级计算系统中,可以使用--gres=gpu:v100:2来指定每个节点使用2块NVIDIA V100 GPU。

4. 编译和运行代码:在作业脚本中,可以指定编译命令和运行命令。例如,使用cuSPARSE库时,可以先编译测试代码,然后运行测试。

5. 提交作业:通过作业管理系统(如SLURM、PBS等)提交作业。例如,使用sbatch命令提交作业脚本。

6. 监控和管理任务:在任务运行过程中,可以通过作业管理系统查看任务状态,并在必要时进行调整。例如,可以在作业页面中配置作业参数并提交作业。

7. 结果输出:任务完成后,可以在指定的输出文件中查看结果。例如,在使用GROMACS-GPU时,可以在.out文件中查看计算结果。

这些步骤适用于大多数高性能计算平台和GPU加速任务的提交方法。具体实现可能因平台和使用的工具不同而有所差异。

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